Наличие комплементарных последовательностей, фланкирующих G4-мотив, которые не могут образовать двойную спираль из-за стерической удаленности, понижают стабильность

G-квадруплексы в микросателлитных повторах: влияние числа G в повторяющейся единице на стабильность неканонической формы и ингибирование топоизомеразы I
Оглоблина Анна Максимовна1
Младший научный сотрудник
Якубовская Марианна Геннадьевна1
Зав.отдела химического канцерогенеза, д.м.н.
Долинная Нина Германовна2
Ведущий научный сотрудник, д.х.н.
Российский Онкологический Центр им. Н.Н. Блохина, НИИ Канцерогенеза
Московский Государственный Университет им. М.В. Ломоносова,
E-mail: [email protected]

Изучена возможность образования G-квадруплексных структур в микросателлитных повторах, которые широко распространены в геномах эукариот и являются «горячими точками» гомологичной рекомбинации – процесса, связанного с поддержанием целостности генома и многостадийным канцерогенезом. Методами КД и УФ-спектроскопии показано, что олигонуклеотиды d(GT)n, d(GGT)n и - d(GGGT)n , имитирующие одну из цепей микросателлитных повторов, образуют внутримолекулярные параллельные G-квадруплексы. Уменьшение количества остатков гуанозина в повторяющейся единице от 3 до 1 приводит к резкой дестабилизации неканонической структуры (Тпл составляет 85, 40 и 12оС, соответственно). Наличие комплементарных последовательностей, фланкирующих G4-мотив, которые не могут образовать двойную спираль из-за стерической удаленности, понижают стабильность G-квадруплексов с параллельной топологией. Далее было изучено влияние охарактеризованных олигонуклеотидов на способность топоизомеразы I релаксировать сверхспирализованные ДНК-плазмиды. Показано, что если олигонуклеотиды образуют G-квадруплексы, стабильные в условиях ферментативной реакции, то они ингибируют активность фермента за счет его связывания с такими структурами. Что касается олигомера d(GT)n, то он не вызывал такого эффекта, поскольку образуемый им G-квадруплекс имел низкую стабильность - 12оС. Однако когда эта последовательность в составе микросателлитного повтора (CA/ТG)n была встроена в плазмиду, то в условиях сверхспирализации G-квадруплекс, образуемый (GT)-содержащей цепью, становился более прочным и ингибировал релаксацию этой самой плазмиды, причем этот процесс зависел от длины вставки.

Приложенные файлы

  • doc 7066206
    Размер файла: 111 kB Загрузок: 0

Добавить комментарий